Nattokinaza, znana również jako proteaza Bacillus subtilis, jest proteazą serynową wytwarzaną przez Bacillus natto podczas fermentacji natto. Może rozpuszczać skrzeplinę, zmniejszać lepkość krwi, poprawiać krążenie krwi, zmiękczać i zwiększać elastyczność naczyń krwionośnych.